被告侵权蛋糕店怎么办？

侵权。专利法第六十条规定，未经专利权人许可实施专利，即侵犯专利权，引起纠纷的，由当事人协商解决；不愿协商或者协商不成的，专利权人或者利害关系人可以向人民法院起诉或者请求管理专利工作的部门处理。