启动子有哪三个碱基
原核表达系统中通常使用的可调控的启动子
有Lac(乳糖启动子)、Trp(色氨酸 启动子)、Tac(乳糖和色氨酸的杂合启动子) 、lPL (l噬菌体 的左向启动子)、T7噬菌体启动子等。(1)Lac启动子:它来自大肠杆菌
的乳糖操纵子 ,是DNA分子 上一段有方向的核苷酸序列,由阻遏蛋白基因(LacI)、启动基因(P)、操纵基因(O)和编码3个与乳糖利用有关的酶的基因结构所组成。Lac启动子受分解代谢 系统的正调控和阻遏物的负调控。正调控通过CAP(catabolite gene activation protein)因子和cAMP来激活启动子,促使转录进行。负调控则是由调节基因产生LacZ阻遏蛋白,该阻遏蛋白能与操纵基因结合阻止转录。乳糖及某些类似物如IPTG可与阻遏蛋白形成复合物,使其构型改变,不能与O基因结合,从而解除这种阻遏,诱导转录发生。(2)trp启动子:它来自大肠杆菌的色氨酸操纵子,其阻遏蛋白必须与色氨酸结合才有活性。当缺乏色氨酸时,该启动子开始转录。当色氨酸较丰富时,则停止转录。b-吲哚
丙烯酸 可竞争性抑制色氨酸与阻遏蛋白的结合,解除阻遏蛋白的活性,促使trp启动子转录。(3)Tac启动子:Tac启动子是一组由Lac和trp启动子人工构建的杂合启动子,受Lac阻遏蛋白的负调节,它的启动能力比Lac和trp都强。其中Tac 1是由Trp启动子的-35区加上一个合成的46 bp DNA片段(包括Pribnow 盒)和Lac操纵基因构成,Tac 12是由Trp的启动子-35区和Lac启动子的-10区,加上Lac操纵子中的操纵基因部分和SD序列融合而成。Tac启动子受IPTG的诱导。
(4)lPL启动子:它来自l噬菌体早期左向转录启动子,是一种活性比Trp启动子高11倍左右的强启动子。lPL启动子受控于温度敏感的阻遏物 cIts857。在低温(30℃)时,cIts857阻遏蛋白可阻遏PL启动子转录。在高温(45℃)时,cIts857蛋白失活,阻遏解除,促使PL启动子转录。系统由于受cIts857作用,尤其适合于表达对大肠杆菌有毒的基因产物,缺点是温度转换不仅可诱导PL启动子,也可诱导热休克基因,其中有一些热休克基因编码蛋白酶
。如果用l噬菌体cI+溶源菌,并用丝裂霉素C或萘啶酮酸进行诱导,可缓解这一矛盾。(5)T7噬菌体启动子:它是来自T7噬菌体的启动子,具有高度的特异性
,只有T7RNA聚合酶 才能使其启动,故可以使克隆化基因独自得到表达。T7RNA聚合酶的效率比大肠杆菌 RNA聚合酶高5倍左右,它能使质粒沿模板连续转录几周,许多外源终止子 都不能有效地终止它的序列,因此它可转录某些不能被大肠杆菌RNA聚合酶有效转录的序列。这个系统可以高效表达其他系统不能有效表达的基因。但要注意用这种启动子时宿主中必须含有T7RNA聚合酶。应用T7噬菌体表达系统需要2个条件:第一是具有T7噬菌体RNA聚合酶,它可以由感染的l噬菌体或由插入大肠杆菌染色体上的一个基因拷贝产生;第二是在一个待表达基因上游带有T7噬菌体启动子的载体。回答于 2011-12-09
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真核生物上游启动子元件包括哪些
真核生物启动子有三类,分别由RNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ进行转录。 类别Ⅰ(class Ⅰ)启动子: 只控制rRNA前体基因的转录,转录产物经切割和加工后生成各种成熟rRNA。 类别Ⅰ启动子由两部分保守序列组成: 核心启动子(core promoter):位于转录起点附近,从-45至+20; 上游控制元件(upstream control element,UCE):位于-180至-107; RNA聚合酶Ⅰ对其转录需要2种因子参与: UBF1:一条M为97000的多肽链,结合在上述两部分的富含GC区; 1个TBP,即TATA结合蛋白(TATA-binding protein,TBP); SL1:一个四聚体蛋白,含有 3个不同的转录辅助因子TAFⅠ; 在SL1因子介导下RNA聚合酶Ⅰ结合在转录起点上并开始转录。类别Ⅱ(class Ⅱ)启动子: 类别Ⅱ启动子涉及众多编码蛋白质的基因表达的控制。 该类启动子包含4类控制元件: 1基本启动子(basal promoter):序列为中心在-25至-30左右的7 bp保守区,TATAAAA/T, 称为TATA框或Goldberg-Hogness 框。与RNA聚合酶的定位有关,DNA双链在此解开并决定转录的起点位置。失去TATA框,转录将在许多位点上开始。 2起始子(initiator):转录起点位置处的一保守序列,***有序列为:PyPyANT(A)PyPy Py为嘧啶碱(C或T),N为任意碱基,A为转录的起点。DNA在此解开并起始转录。 3上游元件(upstream factor):普遍存在的上游元件有CAAT框、GC框和八聚体(octamer) 框等。CAAT框的***有序列是GCCAATCT,GC框的***有序列为GGGCGG和CCGCCC,八聚体框含有8bp,***有序列为ATGCAAAT; 4应答元件(response element):诱导调节产生的转录激活因子与靶基因上的应答元件结合。 如热休克效应元件 HSE 的***有序列是 CNNGAANNTCCNNG,可被热休克因子HSF识别和作用;血清效应元件SRE的***有序列CCATATTAGG,可被血清效应因子SRF识别和作用。参与RNA聚合酶Ⅱ转录起始的各类因子数目很大,可分为3类: 1通用因子(general factor):作用于基本启动子上的辅助因子称为通用(转录)因子(GTF), 或基本转录因子(basal transcription),为任何细胞类别Ⅱ启动子起始转录所必需,以TFⅡⅩ来表示,其中Ⅹ按发现先后次序用英文字母定名,如TFⅡA、TFⅡD、TFⅡH。 2上游因子(upstream factor):或转录辅助因子(transcription ancillary factor),是指识别上 游元件的转录因子。 3可诱导因子(inducible factor):在真核生物中,与细胞类型和发育阶段相关的基因表达, 主要通过转录因子的重新合成来进行调节的,是长期的过程。对外界刺激的快速反应则主要通过转录激活物(transcription activator)的可诱导调节。这些诱导的转录激活因子与靶基因上所谓应答元件相结合。类别Ⅲ(class Ⅲ)启动子: 类别Ⅲ启动子为RNA聚合酶Ⅲ所识别,他涉及一些小分子RNA的转录。 RNA聚合酶Ⅲ的启动子有3种类型结构:1类型1基因内启动子:如5S rRNA基因的启动子,位于转录起点下游,即在基因内部,是 下游启动子,有两个框架序列,被3种辅助因子所识别。5S rRNA基因的启动子包括框架A(box A)、中间元件(intermediate element)和框架C(box C)3个元件组成。TFⅢA结合在框架A上,然后促使TFⅢC结合,后者结合导致TFⅢB结合到转录起点附近,并引导RNA聚合酶Ⅲ结合在起点上。TFⅢB使RNA聚合酶Ⅲ正确定位,起“定位因子”(positioning factor)作用。 2类型2基因内启动子:如tRNA基因的启动子,有两个控制元件,分别为框架A和框架B。 TFⅢC结合框架B,其结合区域包括框架A和框架B,然后导致TFⅢB结合到转录起点附近,并引导RNA聚合酶Ⅲ结合在起点上。 3上游启动子:如snRNA基因的启动子,位于转录起点上游。有3个上游元件:OCT(八 聚体基序 octamer motif)、PSE(邻近序列元件 proximal sequence element)、TATA元件。在RNA聚合酶Ⅲ的上游启动子中,只有靠近起点存在TATA元件,就能起始转录。然而PSE和OCT元件的存在将会增加转录效率。
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启动子有哪些
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细菌的启动子有哪些
细菌的启动子包含几个分散的序列,-35区,扩展的-10区,-10区,σ因子的识别区和由α亚基的羧基末端结构域识别的UP元件。所有的细菌都具有一个必需σ因子,称为管家σ因子(例如大肠杆菌中的σ70;也被称作RpoD ),它负责识别大多数启动子(图1b)。管家σ因子由4个结构域组成,这些结构域通过柔性linkers连接。在RNA聚合酶全酶中,σ因子结合在核心酶的亚基上,使得σ因子的每个结构域都与特定的启动子元件相互作用。σ因子的结构域3和4主要作用是RNA聚合酶的最初定位,结构域1和2主要作用是促进开放复合物的形成。管家σ因子的另一个作用是通过结构域1调节的,它能确保DNA在RNA与启动子结合之前不进入活性区域,当RNA聚合酶与启动子结合后触发构象的改变允许DNA进入活性区域。扩展资料启动子功能变异的疾病:以下是从人类孟德尔遗传学(OMIM)证实与启动子故障有关,不论是因启动子序列直接突变或是转录因子或转录***激发因子的突变。而多种癌症都没有列下是因为从染色体易位产生嵌合基因:哮喘 β地中海贫血、鲁宾斯坦泰比综合症。要留意的是在病原学上大部份的疾病都是异质的,而在分子层面上一种疾病往往是指多种疾病,纵然它们的病征及治疗方法一致。疾病对治疗有不同的反应,是因背后分子源头的差异,这会是药物遗传学的范畴。百度百科-启动子
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