李兰娟赢得了荣誉。

1998国家科技进步二等奖1999被国家授予有突出贡献的中青年专家称号。

2001获中国大学科技二等奖；

2001国家教育部推广应用二等奖

重型肝炎肠道微生态变化研究获2001省科技进步一等奖。

革兰氏阴性菌超广谱β-内酰胺酶和AmpC酶的研究获2003年省科技进步一等奖。

研究成果获2004年省科技进步二等奖。

-建立了我国1永生化人源肝细胞系HepLL，开创了分离肝细胞的新方法，构建了新型生物混合人工肝。该成果获得2006年浙江省科技进步一等奖。

李兰娟院士领衔的浙江大学第一附属医院“重症肝病诊疗理论创新与技术突破”项目获得2013年度国家科技进步一等奖。

获国家科技进步奖一等奖1、二等奖1，省科技进步奖一等奖4项，教育部高校推广应用奖二等奖1；

获得授权专利5项。