专利代理机构两年没开可以退出吗?

当然可以。

担任另一家机构的合伙人或者股东满两年后,才可以退伙或者退股。这主要是为了防止一部分人频繁合伙和退伙(或停业),维持机构的长期有效运行(至少两年)。