专利初步审查合格通知书是否加盖公章。

不会，目前大部分专利申请都是通过系统进行电子提交，知识产权局受理后出具电子受理通知书，不加盖公章。公司公章是公司处理内外事务的印章。公司对外的公函、文件、报告使用公章，加盖公章的文件具有法律效力。