请问专利申请权转让合同可以在专利代理机构备案吗？

法律分析:专利申请权转让合同可以在专利代理机构备案。如果专利实施许可合同的双方是国内的个人、企业或组织，当事人可以到国家知识产权局专利局在中国设立的代理机构办理。

法律依据:《中华人民共和国专利法实施细则》第十四条。除依照专利法第十条的规定外，因其他原因转让专利权的，当事人应当凭有关证明文件或者法律文件向国务院专利行政部门办理专利权转让手续。专利权人与他人订立的专利实施许可合同，应当自合同生效之日起3个月内向国务院专利行政部门备案。

以专利权出质的，出质人和质权人应当向国务院专利行政部门办理质押登记。