如何从3 '端测序和5 '端测序控制cdna测序?

如何从3 '端测序和5 '端测序控制cdna测序?

高通量测序(High-throughput sequencing)又称“下一代测序技术”,其特点是能够一次并行测序数十万到数百万个DNA分子,且一般具有较短的阅读长度。

根据发展历史、影响、测序原理和技术的不同,主要有以下几种:海量平行签名测序、MPSS、Polony测序、454焦磷酸测序、Illumina (Solexa)测序、ABI固体测序、离子半导体测序、DNA纳米球测序等基因分析仪(DNA测序仪)采用毛细管电泳技术代替传统的聚丙烯酰胺平板电泳,采用公司专利的四色荧光染料标记的ddNTP(标记终止子法)。因此,通过单引物PCR测序反应,生成的PCR产物是3’端带有四种不同荧光染料的单链DNA混合物,相差1个碱基,这样四种荧光染料的测序PCR产物可以在一个毛细管中电泳,避免了泳道。由于分子大小不同,毛细管电泳中的淌度也不同。当分子通过毛细管读数窗时,激光检测器窗口中的CCD(电荷耦合器件)摄像检测器可以逐个检测荧光分子。激发的荧光被光栅分割,以区分代表不同基底信息的不同颜色的荧光,图像在CCD相机上同步。分析软件可以自动将不同的荧光转换成DNA序列,从而达到DNA测序的目的。分析结果可以以凝胶电泳图谱、荧光吸收峰图谱或碱基排列顺序等多种形式输出。

它是一种用计算机自动控制,如自动灌胶、自动取样、自动数据采集和分析,测量DNA片段碱基序列、大小和定量的高级精密仪器。PE还提供凝胶聚合物,包括DNA测序凝胶(POP 6)和GeneScan凝胶(POP 4)。这些凝胶颗粒的孔径大小均一,避免了凝胶制备条件不一致对测序准确性的影响。主要由毛细管电泳装置、Macintosh电脑、彩色打印机和电泳配件组成。计算机包括用于数据收集、分析和仪器操作的软件。它采用最新的CCD摄像检测器,将DNA测序缩短至2.5h,PCR片段大小分析和定量分析为10 ~ 40分钟。