公司投资自己申请的专利技术涉及哪些税收和优惠政策？

可以参考以下规定:

1号文件附件3和财税[2013]37号《关于交通运输业和部分现代服务业营业税改征增值税试点过渡政策的规定》，只提到了“试点纳税人提供技术转让、技术开发及相关技术咨询和技术服务，免征增值税”的优惠，并未涉及投资入股。

2.根据《个人所得税法实施条例》规定，特许权使用费所得，是指个人提供专利、商标、著作权、非专利技术以及其他特许经营权取得的所得。自然人以非专利技术使用权投资入股，向公司提供专有技术，取得公司股权，属于提供非专利技术使用权取得其他形式的经济利益(公司股权)，自然人应按“特许权使用费收入”缴纳个人所得税。