厦门大学学术研究
在2010年全球最著名的两大科学期刊之一《自然》杂志发布的《自然出版指数2010中国》报告中，厦门大学的科研实力在全国所有科研机构中排名第9。根据权威国际学术期刊《自然》发布的《自然出版指数2011-中国》报告，厦门大学在中国十大科研机构中排名第六。截至2016年3月，学校拥有200多个研究机构，其中国家协同创新中心2个，国家重点实验室4个，国家工程实验室1个，国家工程技术研究中心1个，国家地方联合工程实验室3个，教育部重点实验室5个，教育部工程研究中心3个，人文社会科学重点研究基地5个。厦门大学国家大学科技园是福建省仅有的两个获得科技部和教育部认可的国家大学科技园之一。
学校还设有厦门大学国情研究院、厦门大学公共政策研究院、厦门大学知识产权研究院、厦门大学王亚南经济研究院、厦门大学财务管理与会计研究院、厦门大学国际法高级研究院、厦门大学教育研究院、厦门大学台湾省研究院、厦门大学南洋研究院、 厦门大学两岸发展研究院、厦门大学南海研究院、萨本东微纳科技研究院。 有厦门大学仿生与软材料研究院、海洋与海岸带发展研究院等14研究机构，也有两岸关系和平发展协同创新中心、能源材料化学协同创新中心等科研平台。固体表面物理化学国家重点实验室、近海海洋环境科学国家重点实验室、细胞应力生物学国家重点实验室、分子疫苗科学与分子诊断学国家重点实验室国家工程研究中心国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心国家工程实验室醇醚酯化学清洁生产国家工程实验室国家地方联合工程实验室国家天然产物源靶向药物地方联合工程实验室、 新能源汽车供电技术国家和地方联合工程实验室、教育部光谱分析与仪器重点实验室、教育部水声通信与海洋信息技术重点实验室、教育部滨海湿地生态系统重点实验室、教育部高性能陶瓷纤维重点实验室、计量经济学重点实验室、厦门大学历史学院、教育部批准的研究机构、 厦门大学人类学研究所、厦门大学中国语言文学研究所、厦门大学华侨教育研究所、厦门大学经济研究所、厦门大学宏观经济研究中心、厦门大学会计发展研究中心、东南亚研究中心、厦门大学马来西亚研究院(中国)、厦门大学高等教育科学研究院、厦门大学高等教育发展研究中心、厦门大学台湾研究中心、 教育部微纳光电材料与器件工程研究中心、教育部电化学技术工程研究中心、教育部物理化学研究所、教育部寄生动物学研究室(厦门大学)、教育部细胞生物学研究室(厦门大学)、厦门大学亚热带海洋研究所、中国海关史研究中心、全国农村社会保险研究中心(受劳动和社会保障部委托)、 福建省分子诊断重点实验室、教育部工程研究中心、福建省等离子体与磁振动研究重点实验室、福建省半导体材料与应用重点实验室、福建省高校微纳系统重点实验室、福建省高校化石能源化学与化工重点实验室、福建省化学生物学重点实验室、福建省高校无机化学与功能材料重点实验室、福建省高校特种陶瓷重点实验室、 福建省特种先进材料重点实验室、福建省制药工程实验室、福建省高校生物医学工程重点实验室、福建省亚热带湿地生态重点实验室、福建省资源微生物重点实验室、福建省神经退行性疾病与衰老研究重点实验室、福建省眼科学与视觉科学重点实验室、福建省陆海界面生态环境重点实验室、福建省阻燃材料重点实验室、福建省类脑智能系统重点实验室、 福建省器官与组织再生实验室、福建省材料基因工程实验室、福建省柔性功能材料实验室、福建省智慧城市感知与计算实验室、福建省新药靶点研究中心福建省经济研究中心(省校* * *)建设、福建省妇女发展研究中心(省校* * *)建设、福建省半导体照明工程技术研究中心、厦门大学集成电路设计工程技术研究中心、福建省医学分子病毒研究中心、福建省抗癌研究中心、 福建省滨海湿地保护与生态修复工程技术研究中心、福建省陶瓷纤维工程技术研究中心、福建省纳米制造工程技术研究中心、福建省核能工程技术研究中心、福建省数据挖掘研究中心、福建省立法研究中心截至2014年2月，福建省财税法治研究中心馆藏资源为14， 厦门大学图书馆纸质藏书481.8万册，电子藏书443.2万册，总藏书925万册。另外订购了6万种在线电子期刊，其中中文期刊2.8万种，外文期刊3.2万种。
图书馆文献的收藏涉及各个学科，尤其是哲学、管理学、政治学、法学、经济学、语言学、历史学、数学、物理学、化学、生物学、海洋学、机械电子工程、计算机科学等学科。，在东南亚研究和台湾研究的信息化建设方面具有鲜明的优势。该馆还拥有大量古籍、光盘、录音带、缩微胶卷等资源，是全国重点古籍保护单位。
该馆是中国高等教育文献保障体系的主要成员馆之一。福建省文献信息服务中心是中国人文社会科学文献中心的学科中心之一。与15个国家和地区的200多所高校图书馆建立了馆际互借和出版物交换关系，教育部在该馆设有科技查新工作站。学术期刊《厦门大学学报(自然科学版)》创刊于1931。是由厦门大学主办，在国内外公开发行的综合性学术期刊(双月刊)，是我国自然科学核心期刊。主要发表自然科学各学科的最新研究成果，包括基础理论研究、应用基础研究和高技术方面的学术论文。自1994以来，被引频次和影响因子处于国内综合性大学前列，被国内外多家核心期刊和数据库收录为发表源，多次被评为全国、华东地区和福建省优秀科技期刊。2001，入选国家新闻出版总署评估的“中国期刊方阵”；2003年被新闻出版总署授予“第二届全国科技期刊100个重点问题奖”。2006年、2008年获教育部科技司颁发的“中国高校优秀科技期刊”奖。2008年荣获“首届福建省十佳期刊”。2009年在全国高校科技期刊“三优”评选中被评为“编辑质量优秀的优秀期刊”。《厦门大学学报》(自然科学版)获得2009年“第四届华东地区优秀期刊奖”。2010获“第三届中国高校优秀科技期刊奖”。2011被评为“第二届中国精品科技期刊”。2011在《中国学术期刊评价报告》(2011-2012)中被评为“中国RCCSE权威学术期刊”。
《厦门大学学报(哲学社会科学版)》是由厦门大学主办、教育部主管的高水平综合性哲学社会科学学术期刊。2003年底，入选教育部首批“哲学社会科学名刊工程”。清华大学中国学术期刊(光盘版)发布的《中国学术期刊影响因子年度报告(人文社会科学，2010版)》数据显示，2009年，该刊被中国学术期刊综合评价数据库引用总频次为3122，综合影响因子为1.692，居全国人文社会科学综合性期刊之首。此外，根据山西师范大学图书馆“高校文科学报论文统计与分析课题组”2001-2006年所做的统计报告，该刊在1998-2002年五年间的平均收录率在全国文科学报中排名第一，在2003-2005年三年间排名第四；其中2001第二，2002年第一，2003年第二，2004年第五，2005年第三。先后入选《中国核心期刊概览》(北京大学)、《中国人文社会科学核心期刊》(中国社会科学院)、《中国社会科学引文索引(CSSCI)精选期刊》(南京大学)等各类文科国家级“核心期刊”和各类评价体系的源期刊。在各种期刊的评比中，也获得了相应的荣誉。在《中国人文社会科学报》举办的四届全国文科学报评选中，均获得最高奖；近年来被评为“华东地区优秀期刊”、“福建省首届十佳期刊”。