可以手工勾选专利申请中需要选择的框吗?我可以手写文档列表中的页面吗?

当然可以手工打勾,但是文档列表的页数要打印出来,如果提交时发现个别错误,可以手工修改。总之,不建议手写专利申请文件,因为一旦有手写内容,就不好说是谁改的,如果被别人改写也很难指责。