找出RNAi技术和TALEN技术的优缺点
ShRNA可以在干细胞、神经细胞、胚胎干细胞等难以转染的细胞中高效表达蛋白质。他的启动子都是外源的,表达蛋白的翻译后修饰可能不够真实,TALEN可以更好的弥补他的缺陷。首先,构建了目标识别模块。TAL的核酸识别单位是重复的34个恒定氨基酸序列,其中12和13位的双氨基酸与A、G、C和T有恒定的对应关系,即ng识别T,HD识别C,NI识别A,NN识别G..为了获得用于鉴定特定核酸序列的TALE,只需要根据DNA序列连续克隆相应的TAL单位。由于物种的基因组大小不同,所选择的特定序列的长度也不同。对于哺乳动物,包括人类,一般选择16-20bp的DNA序列作为识别目标。第二,
塔伦基因敲除
核酸内切酶TALEn可以通过将识别特定DNA序列的Tale与核酸内切酶FokI偶联来构建。而且FokI需要形成二聚体才能发挥活性,大大降低了随机剪切的概率。在实际操作中,需要在目的基因的编码区或外显子与内含子的交界处选择两个相邻(相隔13-22个碱基)的目的序列(一般为16-20个碱基)分别构建TAL识别模块。将两个相邻的靶识别模块融合,克隆到FokI的N端,形成真核表达载体,获得TALEN质粒对。
可以通过将TALEN质粒对转移到细胞中来敲除目标基因。通过TALEN质粒将* * *转入细胞后,表达的融合蛋白分别与靶位点特异性结合。由于两个TALEN融合蛋白中的FokI相互靠近,形成二聚体,发挥非特异性内切酶的活性,在两个靶位点之间切割DNA,形成DSB(双链断裂),诱导DNA损伤修复的机制。细胞可以通过NHEJ(非纯合末端连接)来修复DNA,在这个修复过程中或多或少地缺失或插入一定数量的碱基,导致移码,形成目的基因敲除突变体。
TALEA的转录激活
识别特定DNA序列的TALE与转录因子激活结构域VP64融合,以构建识别启动子上特定DNA序列的转录激活因子TALEA。在实际操作中,需要选择目标基因启动子上游的目标序列(一般为12-18碱基)来构建TAL识别模块。将识别模块TALE融合并克隆到VP64的N端,形成真核表达质粒TALEA。将TALEN质粒转入细胞,表达的融合蛋白与启动子附近的特定DNA序列结合,并通过VP64激活区与Pol II结合,从而激活基因转录,提高内源目的基因的表达。