专利代理费包含在R&D的什么地方？

在管理费里。根据《国家税务总局关于R&D费用税前扣除有关问题的公告》，专利代理费属于管理费，应计入R&D费用的管理费中。R&D费用是指为一个项目的研究和开发所支付的费用。