数字PCR简介
此外,公司发布了6色数字PCR检测系统的开发项目,以增强系统的检测能力,并寻求与诊断领域和诊断试剂制造商的合作机会。
Stilla公司商业运营副总裁Caroline Charky在2019年2月的SLAS大会上发布了高通数字PCR系统Naica HT,以及新的欧泊芯片,每天可以检测≥240个样本,并在本次大会上获得了NPA新产品奖。
Charky表示,“Opal芯片采用了与第一代Naica系统相同的微流控技术,在芯片内部产生液滴。与第一代Naica系统相比,高通Naica HT平台和Opal芯片提高了样品容量,在价格上更具竞争力。”
Naica数字PCR系统由三部分组成:Geode装置包括自动液滴生成和PCR扩增步骤,在自组装液滴阵列上进行PCR扩增大约需要1小时。Prime3液滴读取与分析系统可读取三色荧光,10分钟可读取12个样本。Crystal Miner数据分析可以自动识别三色荧光中的每一个阴性和阳性液滴,最终计算出目标DNA的绝对含量。
“Naica数字PCR系统使用的蓝宝石芯片是第一代芯片,可以运行4个样本,一次3个芯片,每天可以做≥60个样本。然而,在欧洲、亚洲和美国,许多客户都有高通量的需求。现在,通过Naica HT高通数量数字PCR系统,可以在与蓝宝石大小相同的蛋白石芯片上同时进行65,438+06个样品,一个反应可以运行48个样品。”沙尔基说。
Stilla在进行市场调研时发现,一些实验室,尤其是食品检测,肿瘤领域的应用,如肿瘤患者的伴随诊断和药物监测,以及需要数字化qPCR验证阴性结果的大型QCPR实验室,都有高通的需求。
Naica HT高通数字PCR系统还可以进行三色多重反应,每次实验持续2.5小时,每天可以进行五次实验。Charky说,“Naica HT高通数字PCR系统每天可以进行240个样本的检测,也就是可以进行720个目标基因的检测。”
与蓝宝石芯片相比,蛋白石芯片的反应体积更小。
“在蛋白石芯片中,我们将反应体积从25微升减少到8微升,”Charky说。“你可以使用更少的试剂,”她说。对于需要更高灵敏度的实验,Opal chip有组装两个或三个封闭反应孔的策略,在95%置信区间下,灵敏度可以达到0.2copies/25μL。高通Naica HT数字PCR系统兼容蓝宝石芯片和蛋白石芯片。Naica数字PCR系统可以升级到高通Naica HT数字PCR系统。
雅培实验室快速诊断部门的高级科学家王高·乔纳亚正在使用Stilla的Naica数字PCR系统进行产品开发。他们在两年前购买了Naica数字PCR系统,用于液滴PCR和液滴RT-PCR。他们计划开始使用Naica HT和Opal芯片。Joneja认为Naica系统人工操作少,耗材少,操作简单。同时指出,Stilla具有数据回溯功能,便于进行数据质量控制和检查数据原始结果。Joneja指出,实验室肯定不会发现三色检测系统,而买了双色检测系统。
在后续采访中,Charky指出Stilla的专利与Bio-Rad完全不同。“每个部分都不一样,”她说。“这是一种完全不同的技术。”
与此同时,Stilla正在开发一个用于六色检测的数字PCR系统,以检测多个目标基因。“我们是世界上第一家开发六色数字PCR系统的公司,”Charky说。
如之前报道,2017发表了三色数字PCR检测EGFR突变,本月在O ncotarget杂志发表了液体活检法检测非小细胞肺癌相关突变,尤其是EGFR基因的致敏和耐药突变。
“六色数字PCR系统仍处于测试阶段,Stilla预计将于2020年或2021年发布,”Charky说。“我们公司作为一家仪器制造商,正在与使用Naica开发和优化试剂的公司一起开发试剂,”Charky说。“一家使用Naica系统的德国R&D公司正在开发一种转基因生物的数字PCR检测方法。Stilla计划与这家公司合作推出完整的解决方案,蒙彼利埃的另一家公司正在为CE-IVD开发CTC和液体活检试剂盒。与此同时,该公司还开发自己的临床项目,”Charky说。"产品与现有的研发项目终于可以获得CE-IVD . "
自2016发布Naica系统以来,公司已经走过了三年,Charky说,最近获得了illumina的融资。同时,它也是由欧盟和皇家飞利浦主导的改善癌症护理的“利马”项目的合作伙伴。
去年,Stilla赢得了巴黎39家医院组成的财团的公开招标,该财团将在未来4年内完成Naica系统的采购。Charky说,为了支持企业的快速发展,该公司正在扩张,到今年年底,其面积将增加两倍。
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