问:如果发现从A到B的有机合成新的合成路线和方法，与现有文献报道的不同，可以申请专利吗？！

这个主要看你的路线有没有突破。一般来说，搞学术的都没有申请过专利，只是发表过文章。申请专利一般有两个因素。第一，你的路线好到可以产生JACS，甚至更高，比如自然...几乎没有保护基团，有几种独特的方法论，比如级联反应。一步反应决定了几个固体中心。而别人用了30多步，你用了10步。第二种是你的分子非常需要工业或者医药工业。这样一来，如果他们想使用你的方法进行批量生产，就必须得到你的许可，这就需要你申请专利。不然你为一个没人要的分子申请专利也没用。